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棉花基因组学研究获重大进展
[发布时间:2012-09-10] [TBS信息中心] [关键字:
棉花
基因
进展
] [编辑人:布道]
从河南省安阳市召开的“二倍体棉花—雷蒙德氏棉全基因组图绘制完成”新闻发布会上获悉,在中国农业科学院棉花研究所的主持下,深圳华大基因研究院、北京大学、美国农业部南方平原研究中心、哥本哈根大学、荷兰瓦赫宁根大学等单位共同合作完成了二倍体棉花—雷蒙德氏棉的全基因组草图。日前,研究成果以《二倍体棉花—雷蒙德氏棉的基因组草图》为题在线发表于国际学术期刊《自然—遗传学》。
业内专家表示,该成果将对棉花基础研究和应用研究发挥巨大的推动作用,为我国棉花重要功能基因挖掘与利用、分子育种,乃至全基因组设计育种提供前所未有的机遇。
据了解,棉花除作为全球重要的经济作物之外,还是一种研究多倍体化、细胞伸长和细胞壁生物合成极好的模式系统。雷蒙德氏棉是现在陆地棉祖先的两个供体种之一,该棉花基因草图的完成,为进一步解析陆地棉全基因组序列奠定了坚实的基础。
研究团队采用全基因组鸟枪法结合新一代的高通量DNA测序技术,对雷蒙德氏棉进行了全基因组测序,获得了其87.7%的全基因组序列。研究结果证明,棉花基因组经历了真双子叶植物共同经历的一次古六倍化事件和一次棉属特异的全基因组复制事件,表明了其古多倍体起源。
此外,研究人员推测雷蒙德氏棉基因组约包含40976个蛋白质编码基因,并从基因组注释结果中发现了2706个转录因子,其中大量的MYB和bHLH基因在花后0天和3天的胚珠中表达。该结果暗示这些基因可能为早期纤维发育所必需。
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